Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc4E9Q236 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc4E9Q236 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Abcc4E9Q236 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc4E9Q236 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Abcc4E9Q236 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Abcc4E9Q236 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Abcc4E9Q236 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc4E9Q236 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc4E9Q236 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms