Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp558E9Q1J0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp558E9Q1J0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Zfp558E9Q1J0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Zfp558E9Q1J0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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