Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl3lE9PWZ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl3lE9PWZ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl3lE9PWZ3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms