Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930558K02RikE0CXC6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930558K02RikE0CXC6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930558K02RikE0CXC6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms