Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28043E0CXC2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28043E0CXC2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28043E0CXC2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms