Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6E3

Chst13, Carbohydrate sulfotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst13D3Z6E3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chst13D3Z6E3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chst13D3Z6E3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst13D3Z6E3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms