Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930455H04RikD3Z622 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930455H04RikD3Z622 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930455H04RikD3Z622 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930455H04RikD3Z622 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms