Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms