Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim30cD3YVI9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim30cD3YVI9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms