Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC8

Smok3a, Sperm motility kinase 3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3aC0HKC8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smok3aC0HKC8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smok3aC0HKC8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smok3aC0HKC8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smok3aC0HKC8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smok3aC0HKC8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smok3aC0HKC8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smok3aC0HKC8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smok3aC0HKC8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smok3aC0HKC8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smok3aC0HKC8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smok3aC0HKC8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smok3aC0HKC8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Smok3aC0HKC8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smok3aC0HKC8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smok3aC0HKC8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smok3aC0HKC8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smok3aC0HKC8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms