Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Cttnbp2B9EJA2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Cttnbp2B9EJA2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Cttnbp2B9EJA2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Cttnbp2B9EJA2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Cttnbp2B9EJA2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Cttnbp2B9EJA2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Cttnbp2B9EJA2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Cttnbp2B9EJA2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Cttnbp2B9EJA2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Cttnbp2B9EJA2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Cttnbp2B9EJA2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Cttnbp2B9EJA2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms