Protein–RNA interactions for Protein: B7ZMY3

A930018M24Rik, RIKEN cDNA A930018M24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930018M24RikB7ZMY3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A930018M24RikB7ZMY3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A930018M24RikB7ZMY3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A930018M24RikB7ZMY3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A930018M24RikB7ZMY3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A930018M24RikB7ZMY3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A930018M24RikB7ZMY3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A930018M24RikB7ZMY3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A930018M24RikB7ZMY3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A930018M24RikB7ZMY3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A930018M24RikB7ZMY3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A930018M24RikB7ZMY3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A930018M24RikB7ZMY3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A930018M24RikB7ZMY3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.4 ms