Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col4a6B1AVK5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a6B1AVK5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a6B1AVK5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms