Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV5

Gm13119, Predicted gene 13119, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13119B1ARV5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm13119B1ARV5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13119B1ARV5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm13119B1ARV5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm13119B1ARV5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm13119B1ARV5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm13119B1ARV5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm13119B1ARV5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm13119B1ARV5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm13119B1ARV5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms