Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930435E12RikA6X8Z9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930435E12RikA6X8Z9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms