Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms