Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhox3fA2ANE1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhox3fA2ANE1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox3fA2ANE1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms