Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c4A2ANA3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c4A2ANA3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn34c4A2ANA3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn34c4A2ANA3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn34c4A2ANA3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34c4A2ANA3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms