Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin3aA2AIR5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin3aA2AIR5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms