Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Camsap1A2AHC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Camsap1A2AHC3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Camsap1A2AHC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Camsap1A2AHC3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Camsap1A2AHC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Camsap1A2AHC3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Camsap1A2AHC3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Camsap1A2AHC3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Camsap1A2AHC3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Camsap1A2AHC3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Camsap1A2AHC3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.58
Camsap1A2AHC3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Camsap1A2AHC3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Camsap1A2AHC3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Camsap1A2AHC3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Camsap1A2AHC3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Camsap1A2AHC3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Camsap1A2AHC3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Camsap1A2AHC3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Camsap1A2AHC3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Camsap1A2AHC3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Camsap1A2AHC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Camsap1A2AHC3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Camsap1A2AHC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Camsap1A2AHC3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Camsap1A2AHC3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms