Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm11A2AGX3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm11A2AGX3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm11A2AGX3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm11A2AGX3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm11A2AGX3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms