Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rbbp8nlA2ABX0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rbbp8nlA2ABX0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rbbp8nlA2ABX0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbbp8nlA2ABX0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms