Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprfA2A8L5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprfA2A8L5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprfA2A8L5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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