Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hivep3A2A884 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hivep3A2A884 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hivep3A2A884 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.5 ms