Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rsg1A2A825 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsg1A2A825 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsg1A2A825 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms