Protein–RNA interactions for Protein: A1Y9I9

Tomt, Transmembrane O-methyltransferase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TomtA1Y9I9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TomtA1Y9I9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TomtA1Y9I9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TomtA1Y9I9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TomtA1Y9I9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms