Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Trbv21A0A0A6YX06 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv21A0A0A6YX06 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv21A0A0A6YX06 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Trbv21A0A0A6YX06 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trbv21A0A0A6YX06 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv21A0A0A6YX06 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Trbv21A0A0A6YX06 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv21A0A0A6YX06 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Trbv21A0A0A6YX06 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv21A0A0A6YX06 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Trbv21A0A0A6YX06 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv21A0A0A6YX06 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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