Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms