Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms