Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms