Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pgpep1Q9ESW8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms