Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms