Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms