Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
H2al1mQ9DAD9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms