Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifi35Q9D8C4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms