Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms