Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl20Q9CQL4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms