Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGIP1Q9BQI5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms