Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms