Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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