Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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