Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk8Q8R3L8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk8Q8R3L8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk8Q8R3L8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk8Q8R3L8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk8Q8R3L8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk8Q8R3L8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk8Q8R3L8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk8Q8R3L8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk8Q8R3L8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms