Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Hoxc12Q8K5B8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Hoxc12Q8K5B8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Hoxc12Q8K5B8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Hoxc12Q8K5B8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Hoxc12Q8K5B8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Hoxc12Q8K5B8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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Hoxc12Q8K5B8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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Hoxc12Q8K5B8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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