Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8CF25 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8CF25 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8CF25 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8CF25 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8CF25 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8CF25 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8CF25 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8CF25 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8CF25 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8CF25 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8CF25 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q8CF25 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms