Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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