Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms