Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms