Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp1Q8BJQ2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp1Q8BJQ2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp1Q8BJQ2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp1Q8BJQ2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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