Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms