Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms